Satu setengah tahun setelah kejadian dalam film thriller psikologis fiksi ilmiah asli, Akane Tsunemori melanjutkan pekerjaannya sebagai inspektur—menegakkan penilaian Sistem Sibyl. Bergabung dengannya adalah penegak hukum baru dan inspektur junior Mika Shimotsuki, seorang wanita muda yang setia kepada Sibyl secara membabi buta dan tidak fleksibel. Saat Akane merenungkan sifat pekerjaannya dan keabsahan putusan Sibyl, ancaman baru yang meresahkan pun muncul.
Seorang tokoh misterius telah menemukan cara untuk mengontrol Koefisien Kejahatan—angka yang dikumpulkan dari pemindaian mental yang memungkinkan Sibyl mengukur kesehatan psikologis dan mengidentifikasi calon penjahat. Melalui cara ini, dia mampu membunuh seorang penegak hukum, meninggalkan petunjuk samar: "WC?" tertulis dengan darah di dinding.
Akane dan seluruh Divisi 01 segera mendapati diri mereka memainkan permainan mematikan melawan musuh baru mereka, berhadapan dengan konspirasi yang mengancam tidak hanya otoritas Sistem Sibyl, namun juga fondasi keyakinan Akane sendiri.
